Le directeur général de Centrale Lille par ses décisions, le conseil d’administration par ses délibérations, le conseil scientifique, le conseil des études, les conseils de département de formation, les comités, les commissions par leurs avis, contribuent à l’administration de l’établissement.

L’établissement organise son activité de formation et de recherche à travers ses écoles internes, ses départements d’enseignement, ses laboratoires de recherche, ses pôles supports et soutien (par exemple le pôle des ressources informatiques, le pôle des relations internationales et académiques…).